2013年10月，因南京市委市政府主要领导违纪违法，发生《全国文明城市测评体系》中"一票否决"相关事项，南京市被中央文明办停止全国文明城市资格。

　　"停牌"两年来，南京始终紧抓文明城市创建工作不放松，在深化培育和践行社会主义核心价值观、不断提升市民文明素质、推进志愿之城建设、开展专项城市环境整治等领域进一步深化文明城市创建工作。

　　2016年春节前，中央文明办与环保部、国家统计局相关司局组成专项督查组，通过实地暗访、调研考察、召开座谈会等方式对南京市深化文明城市创建工作进行了专项督查。专项督查组在南京通过步行观察，乘坐公交、出租车等方式，走访了玄武、鼓楼两区30多条街道小巷、5个广场、6所学校、6处旅游景点、5个商场超市、20余处公交站点、5个窗口单位等部门，暗访途中与多位市民进行交流，全面深入地了解南京市两年来的文明城市创建工作。

　　督查组暗访发现，南京市环境卫生情况总体保持良好，主次干道、大街小巷、商业街区、景点景区、公共场所干净整洁、环境优美，为广大市民创造了宜居、宜业、宜游的城市环境。暗访区域的建筑围挡、公共广场、城市公共自行车租赁点等点位中，随处可见平面广告、电子显示屏、宣传栏等载体进行的社会主义核心价值观宣传展示，南京市营造的核心价值观宣传浓厚氛围获督查组认可。

　　南京市民的高素质在中央文明办督查组的暗访中也得到认可。在重点交通路口、主次干道，督查组发现市民遵守交通法规自觉性较高，绝大多数按照信号指示灯过马路;南京司机"礼让斑马线"的文明之举也获督查组"点赞"。

　　暗访调研结束后，中央文明办专项督查组召开工作座谈会，对督查暗访情况进行反馈。督查组认为，南京是全国文明城市创建的排头兵，是首批获得全国文明城市荣誉称号的省会城市，是省会城市中创建先行者。虽停牌两年，但市委、市政府高度重视，创建目标不变，创建干劲不松，全市创建工作做到了基础深厚，重点突出，举措有效，成绩显著。创建工作不但没有停步，而且有了新体征，因此南京顺利复牌"全国文明城市"。[8]